Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp1b1Q99LU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp1b1Q99LU0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Chmp1b1Q99LU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chmp1b1Q99LU0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp1b1Q99LU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms