Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q99KU6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q99KU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q99KU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q99KU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q99KU6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q99KU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q99KU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q99KU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q99KU6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q99KU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q99KU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q99KU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q99KU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q99KU6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q99KU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q99KU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q99KU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q99KU6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q99KU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q99KU6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q99KU6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q99KU6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q99KU6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q99KU6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q99KU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q99KU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q99KU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q99KU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q99KU6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q99KU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q99KU6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q99KU6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q99KU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q99KU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q99KU6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q99KU6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q99KU6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q99KU6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q99KU6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q99KU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q99KU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q99KU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q99KU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q99KU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q99KU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q99KU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q99KU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q99KU6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q99KU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q99KU6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q99KU6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q99KU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q99KU6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q99KU6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q99KU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q99KU6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q99KU6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q99KU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q99KU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q99KU6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q99KU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q99KU6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q99KU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q99KU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q99KU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q99KU6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q99KU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q99KU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q99KU6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q99KU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q99KU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q99KU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q99KU6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q99KU6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q99KU6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99KU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99KU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99KU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99KU6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99KU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99KU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q99KU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q99KU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q99KU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q99KU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q99KU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q99KU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q99KU6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q99KU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q99KU6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q99KU6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q99KU6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q99KU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q99KU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q99KU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99KU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99KU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99KU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q99KU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms