Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ciao1Q99KN2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ciao1Q99KN2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ciao1Q99KN2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ciao1Q99KN2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ciao1Q99KN2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ciao1Q99KN2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ciao1Q99KN2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms