Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrm1Q99J25 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrm1Q99J25 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrm1Q99J25 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrm1Q99J25 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrm1Q99J25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrm1Q99J25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrm1Q99J25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrm1Q99J25 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms