Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfxn4Q925N1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfxn4Q925N1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfxn4Q925N1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfxn4Q925N1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sfxn4Q925N1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sfxn4Q925N1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfxn4Q925N1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sfxn4Q925N1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms