Protein–RNA interactions for Protein: Q924X6

Lrp8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp8Q924X6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrp8Q924X6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrp8Q924X6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrp8Q924X6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrp8Q924X6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrp8Q924X6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrp8Q924X6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms