Protein–RNA interactions for Protein: Q921Q7

Rin1, Ras and Rab interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin1Q921Q7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rin1Q921Q7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rin1Q921Q7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rin1Q921Q7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rin1Q921Q7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rin1Q921Q7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rin1Q921Q7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms