Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdha5Q91Y15 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha5Q91Y15 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha5Q91Y15 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha5Q91Y15 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha5Q91Y15 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms