Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tm4sf4Q91XD3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tm4sf4Q91XD3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tm4sf4Q91XD3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tm4sf4Q91XD3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tm4sf4Q91XD3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tm4sf4Q91XD3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tm4sf4Q91XD3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tm4sf4Q91XD3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tm4sf4Q91XD3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tm4sf4Q91XD3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tm4sf4Q91XD3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tm4sf4Q91XD3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tm4sf4Q91XD3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms