Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsmce2Q91VT1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsmce2Q91VT1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsmce2Q91VT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsmce2Q91VT1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce2Q91VT1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms