Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx7Q8VDS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx7Q8VDS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx7Q8VDS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx7Q8VDS3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx7Q8VDS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms