Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gle1Q8R322 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gle1Q8R322 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gle1Q8R322 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gle1Q8R322 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gle1Q8R322 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gle1Q8R322 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gle1Q8R322 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gle1Q8R322 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gle1Q8R322 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gle1Q8R322 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gle1Q8R322 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gle1Q8R322 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms