Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZW7

Gabrp, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrpQ8QZW7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GabrpQ8QZW7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GabrpQ8QZW7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GabrpQ8QZW7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabrpQ8QZW7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GabrpQ8QZW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms