Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpv3Q8K424 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpv3Q8K424 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpv3Q8K424 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv3Q8K424 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv3Q8K424 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv3Q8K424 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv3Q8K424 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv3Q8K424 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv3Q8K424 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpv3Q8K424 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms