Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsl1Q8K305 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsl1Q8K305 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsl1Q8K305 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nsl1Q8K305 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsl1Q8K305 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms