Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Otud6bQ8K2H2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Otud6bQ8K2H2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Otud6bQ8K2H2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud6bQ8K2H2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud6bQ8K2H2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms