Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arfip2Q8K221 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arfip2Q8K221 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfip2Q8K221 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arfip2Q8K221 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip2Q8K221 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms