Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8K039 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8K039 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8K039 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8K039 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8K039 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8K039 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8K039 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8K039 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8K039 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8K039 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8K039 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8K039 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8K039 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8K039 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8K039 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8K039 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8K039 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8K039 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8K039 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8K039 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8K039 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8K039 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8K039 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8K039 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8K039 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8K039 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8K039 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8K039 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8K039 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8K039 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8K039 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8K039 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8K039 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8K039 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8K039 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8K039 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8K039 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8K039 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8K039 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8K039 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8K039 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8K039 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8K039 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8K039 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8K039 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8K039 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8K039 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8K039 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8K039 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8K039 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8K039 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8K039 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8K039 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8K039 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8K039 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8K039 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8K039 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8K039 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8K039 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8K039 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8K039 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8K039 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8K039 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8K039 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8K039 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8K039 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8K039 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8K039 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8K039 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8K039 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8K039 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8K039 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8K039 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8K039 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8K039 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8K039 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8K039 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8K039 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8K039 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8K039 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8K039 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8K039 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8K039 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8K039 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8K039 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8K039 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8K039 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8K039 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8K039 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8K039 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8K039 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8K039 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8K039 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8K039 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8K039 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8K039 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8K039 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8K039 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8K039 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms