Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H2-Q4Q8HWB2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H2-Q4Q8HWB2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.53■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H2-Q4Q8HWB2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H2-Q4Q8HWB2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H2-Q4Q8HWB2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
H2-Q4Q8HWB2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H2-Q4Q8HWB2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H2-Q4Q8HWB2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H2-Q4Q8HWB2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H2-Q4Q8HWB2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H2-Q4Q8HWB2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H2-Q4Q8HWB2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H2-Q4Q8HWB2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms