Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rftn2Q8CHX7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rftn2Q8CHX7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rftn2Q8CHX7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rftn2Q8CHX7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rftn2Q8CHX7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rftn2Q8CHX7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rftn2Q8CHX7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rftn2Q8CHX7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rftn2Q8CHX7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rftn2Q8CHX7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms