Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ep400Q8CHI8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ep400Q8CHI8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ep400Q8CHI8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ep400Q8CHI8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ep400Q8CHI8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ep400Q8CHI8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ep400Q8CHI8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ep400Q8CHI8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ep400Q8CHI8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ep400Q8CHI8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ep400Q8CHI8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms