Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc28bQ8CEG5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc28bQ8CEG5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc28bQ8CEG5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc28bQ8CEG5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc28bQ8CEG5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms