Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gpc5Q8CAL5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpc5Q8CAL5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpc5Q8CAL5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpc5Q8CAL5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpc5Q8CAL5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpc5Q8CAL5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc5Q8CAL5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms