Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfibp1Q8C8U0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfibp1Q8C8U0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfibp1Q8C8U0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppfibp1Q8C8U0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfibp1Q8C8U0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfibp1Q8C8U0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfibp1Q8C8U0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms