Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot2Q8C5L3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot2Q8C5L3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot2Q8C5L3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot2Q8C5L3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot2Q8C5L3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnot2Q8C5L3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms