Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ssuh2Q8C3L1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Ssuh2Q8C3L1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ssuh2Q8C3L1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ssuh2Q8C3L1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ssuh2Q8C3L1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ssuh2Q8C3L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ssuh2Q8C3L1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Ssuh2Q8C3L1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ssuh2Q8C3L1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Ssuh2Q8C3L1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21,73■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Ssuh2Q8C3L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ssuh2Q8C3L1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms