Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Camsap2Q8C1B1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Camsap2Q8C1B1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap2Q8C1B1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap2Q8C1B1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Camsap2Q8C1B1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap2Q8C1B1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Camsap2Q8C1B1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Camsap2Q8C1B1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Camsap2Q8C1B1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Camsap2Q8C1B1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Camsap2Q8C1B1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Camsap2Q8C1B1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Camsap2Q8C1B1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Camsap2Q8C1B1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Camsap2Q8C1B1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms