Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx16Q8C080 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx16Q8C080 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx16Q8C080 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx16Q8C080 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx16Q8C080 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx16Q8C080 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms