Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZT5

Lrrc19, Leucine-rich repeat-containing protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc19Q8BZT5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc19Q8BZT5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc19Q8BZT5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc19Q8BZT5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc19Q8BZT5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrrc19Q8BZT5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc19Q8BZT5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc19Q8BZT5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc19Q8BZT5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc19Q8BZT5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc19Q8BZT5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc19Q8BZT5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms