Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam53cQ8BXQ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam53cQ8BXQ8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam53cQ8BXQ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam53cQ8BXQ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Fam53cQ8BXQ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam53cQ8BXQ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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