Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rccd1Q8BTU7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rccd1Q8BTU7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rccd1Q8BTU7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rccd1Q8BTU7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rccd1Q8BTU7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms