Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gjd4Q8BSD4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gjd4Q8BSD4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gjd4Q8BSD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Gjd4Q8BSD4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gjd4Q8BSD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gjd4Q8BSD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjd4Q8BSD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gjd4Q8BSD4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjd4Q8BSD4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjd4Q8BSD4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gjd4Q8BSD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gjd4Q8BSD4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gjd4Q8BSD4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjd4Q8BSD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjd4Q8BSD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms