Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap4Q8BMK4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ckap4Q8BMK4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap4Q8BMK4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap4Q8BMK4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap4Q8BMK4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms