Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Grik4Q8BMF5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grik4Q8BMF5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grik4Q8BMF5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grik4Q8BMF5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Grik4Q8BMF5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grik4Q8BMF5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Grik4Q8BMF5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grik4Q8BMF5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grik4Q8BMF5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik4Q8BMF5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grik4Q8BMF5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Grik4Q8BMF5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Grik4Q8BMF5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grik4Q8BMF5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms