Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c2Q8BL74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c2Q8BL74 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf3c2Q8BL74 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c2Q8BL74 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf3c2Q8BL74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c2Q8BL74 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf3c2Q8BL74 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms