Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gcfc2Q8BKT3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gcfc2Q8BKT3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcfc2Q8BKT3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcfc2Q8BKT3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcfc2Q8BKT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcfc2Q8BKT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcfc2Q8BKT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms