Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU9

Mtrf1l, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtrf1lQ8BJU9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtrf1lQ8BJU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtrf1lQ8BJU9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mtrf1lQ8BJU9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mtrf1lQ8BJU9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtrf1lQ8BJU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mtrf1lQ8BJU9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mtrf1lQ8BJU9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mtrf1lQ8BJU9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mtrf1lQ8BJU9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtrf1lQ8BJU9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtrf1lQ8BJU9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms