Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp2bQ8BJF9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp2bQ8BJF9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp2bQ8BJF9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp2bQ8BJF9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp2bQ8BJF9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp2bQ8BJF9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms