Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Htatsf1Q8BGC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Htatsf1Q8BGC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Htatsf1Q8BGC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Htatsf1Q8BGC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Htatsf1Q8BGC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Htatsf1Q8BGC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms