Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf187Q8BFX1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf187Q8BFX1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rnf187Q8BFX1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf187Q8BFX1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf187Q8BFX1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf187Q8BFX1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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