Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thnsl2Q80W22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thnsl2Q80W22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Thnsl2Q80W22 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thnsl2Q80W22 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Thnsl2Q80W22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Thnsl2Q80W22 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms