Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf18Q7TS55 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf18Q7TS55 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms