Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf2Q7TMI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Uhrf2Q7TMI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Uhrf2Q7TMI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf2Q7TMI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uhrf2Q7TMI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms