Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brd2Q7JJ13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brd2Q7JJ13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd2Q7JJ13 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd2Q7JJ13 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd2Q7JJ13 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Brd2Q7JJ13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd2Q7JJ13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brd2Q7JJ13 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd2Q7JJ13 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd2Q7JJ13 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Brd2Q7JJ13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brd2Q7JJ13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms