Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnih3Q6ZWS4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnih3Q6ZWS4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cnih3Q6ZWS4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cnih3Q6ZWS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnih3Q6ZWS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms