Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spcs3Q6ZWQ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spcs3Q6ZWQ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spcs3Q6ZWQ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spcs3Q6ZWQ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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