Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zc3h4Q6ZPZ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zc3h4Q6ZPZ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zc3h4Q6ZPZ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zc3h4Q6ZPZ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms