Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Kdm3bQ6ZPY7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Kdm3bQ6ZPY7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
Kdm3bQ6ZPY7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35,82■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Kdm3bQ6ZPY7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Kdm3bQ6ZPY7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35,7■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Kdm3bQ6ZPY7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35,57■■■■□ 3,29
Kdm3bQ6ZPY7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35,55■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35,53■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Kdm3bQ6ZPY7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Kdm3bQ6ZPY7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,4■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35,4■■■■□ 3,26
Kdm3bQ6ZPY7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Kdm3bQ6ZPY7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Kdm3bQ6ZPY7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Kdm3bQ6ZPY7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Kdm3bQ6ZPY7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Kdm3bQ6ZPY7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms