Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Zbtb40Q6PCS8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Zbtb40Q6PCS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Zbtb40Q6PCS8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Zbtb40Q6PCS8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Zbtb40Q6PCS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Zbtb40Q6PCS8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Zbtb40Q6PCS8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Zbtb40Q6PCS8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Zbtb40Q6PCS8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Zbtb40Q6PCS8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Zbtb40Q6PCS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Zbtb40Q6PCS8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Zbtb40Q6PCS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Zbtb40Q6PCS8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Zbtb40Q6PCS8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Zbtb40Q6PCS8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Zbtb40Q6PCS8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Zbtb40Q6PCS8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Zbtb40Q6PCS8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,37
Zbtb40Q6PCS8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,36
Zbtb40Q6PCS8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Zbtb40Q6PCS8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
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