Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAN7

Prr18, Proline-rich protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr18Q6PAN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr18Q6PAN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr18Q6PAN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prr18Q6PAN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prr18Q6PAN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prr18Q6PAN7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prr18Q6PAN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr18Q6PAN7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prr18Q6PAN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr18Q6PAN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr18Q6PAN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prr18Q6PAN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms